まずはこのスケジュールは9月じゃないと無理ですよ。10月以降は西表〜鳩間〜石垣の船は安栄のみになりますので。つまり10月以降は西表→鳩間へは夕方の船のみになります。郵便船などで渡ることも出来ますが、この場合は平日のみしか運行しないので曜日次第の点もあります。
あと
シュノーケリングについてはまずはスクール的なレッスンをツアーで受けると良いでしょう。その2日目の西表島に渡る前に参加すると良いかと思います。半日程度なら白保あたりが良いのではないでしょうか?石垣市街からも近いし、半日もかかりませんので。その場合は民宿系のツアーは何も教えてくれない可能性もありますので、
専業系のツアーが良いかと思います。この掲示板だとブルーコーラルさんに参加した方が多いみたいで、良かったようですよ。
http://www.ritou.com/sitemap/_redirect.cgi?bluecoralちなみにマリングッズについては全く逆だと思います。フィンやブーツは無くてもどうにかなりますが(でもブーツは欲しいが)、マスクとシュノーケル無しってのは全然楽しめないと思います。このマスクとシュノーケルが最も必要だと思います。でないと海の中で息継ぎが出来ませんからね。あとお子さんの場合はライフジャケットがあると良いですね。フィンよりも安全性を重視した方が良いかと思いますので。
最後に8日目の石垣島の宿ですが、ちょっとご質問の意味がわかりませんが、最初にミヤヒラに泊まるなら最後もミヤヒラでも良いかと思うのですが。それと離島桟橋近くにはホテルは何軒もありますので、おすすめというよりも好みで選んでくださいとしか言えないと思いますよ。
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