1.時間的には可能ですが(乗り継ぎ45分前後なので)、問題は空席があるか否かかと思います。まぁもしダメなら石垣市街でランチをゆっくり取って、夕方の便で行けば良いだけですけどね。なので気楽に考えましょう。
2.5日目に白保に行ってシュノーケリングツアーに参加するのが良いと思います。白保なら泳ぐことももちろん出来ますし、泳がない人がいてもグラスボートなので十分楽しめますからね。あとは
石垣島だと米原でシュノーケリングをしたり、川平で散策&グラスボートなんかもおすすめかと思います。それ以外だと西表島でバラスツアーかな?こちらもシュノーケリング&グラスボートのコースがありますので、お子さんでもご両親でも楽しめると思いますよ(しかも無人島ことバラスに上陸も出来ますし)。
http://www.ritou.com/spot/view-barasu-b204.html2.西表島で気軽にジャングルを体験するなら、ツアーも良いですが浦内川へ行かれるのがオススメですね。ここならツアーじゃないので時間的にも自由ですからね。まずは浦内川河口へ行って遊覧船に乗ってマングローブの広がる川を上流まで行けます。これだけでも十分ジャングルを体験できますが、上流から先は滝巡りのトレッキング(遊歩道なので気楽に歩けます)もできますので、さらにジャングルを身近に感じることが出来ると思います。
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