沖縄離島ドットコム

まず、最終日は時間の関係から竹富島がおすすめかと思います。石垣島は広いので1日かけた方がおすすめかと思います。

竹富島での水牛車に乗るか否かはなんとも言えません。なにせ歩く速度とほとんど変わらないですからね。でも炎天下の中だと歩くのはかなりきついですし、自転車でも舗装されていない道なので走りにくいという意味で、水牛車だと快適に観光ができる（説明付き）という考えもあります。あとは現地で判断されてもいいと思いますよ。とりあえず集落まで行って実際に見てみて判断すると良いでしょう。

石垣島観光に関しては宿泊がサンシャインなのでレンタカーが必須かと思いますので、とりあえずホテル発着で一周すると良いでしょう。ナイトツアーへの参加は石垣島観光を終わってからでOKかと思いますし。石垣島はレンタカーで一周して、途中1ヶ所ぐらいなら泳げると思いますので、米原あたりでフリーで泳ぐといいと思いますよ。マリングッズのレンタルもありますので気ままに行って泳ぐと良いかと思います。もちろん半日ぐらいのツアーに参加してもいいと思いますが、個人的にはツアーだと時間に制約があるし石垣島観光の時間も少なくなっちゃうので、のんびりする意味でツアーにはあえて参加しなくてもいいかな？って思います。