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恩納村から慶良間海域でのダイビングならありますよ。でも那覇発に比べてかなり高いと思います。またシュノーケリングに関しては恩納村発はニーズが少ないので無さそうですね。あくまで単価が高いダイビングもしくは体験ダイビングという前提ならあるかもしれません。

なので体験ダイビングでいいならホテルのツアーデスクにでも聞けばショップを探せると思いますが、シュノーケリングなら那覇まで車で戻って個人手配で慶良間の島に日帰りするのがオススメです。安いし自由ですからね。満足度の面でも個人で慶良間へ渡ってシュノーケリングした方が良いかと思いますよ。体験ダイビングはどうしてもそんなに満足度は高くないですし、またあくまで「慶良間海域」へ行くだけで慶良間の島々の近くまで行くとは限りませんからね。一応慶良間と本島の間にある「チービシ」も慶良間扱いのショップもありますし。

島への上陸も考えるなら那覇まで戻って個人で行った方が良いですよ。シュノーケリングも含めて楽しめるかと思います。

まず、名護からの慶良間周辺でのダイビングはあまり無いと思います。恩納村からでも読谷村近くまで南下しないと、慶良間までの距離を考えるとなかなか難しいと思います。ですので名護ステイの際は慶良間は諦めて、伊江島や本部半島周辺のポイントを潜ることをおすすめします。
恩納村ステイの場合は慶良間まで行くショップもありますので、あとは個々のショップに問い合わせしてみてください。管理人はダイビングはしませんので、あとはご自分でお探しください。

でもここなら恩納村発の慶良間ダイブもありましたので参考まで。なので恩納村まで南下して参加するのがいいかと思います。
http://www.ds-ease.com/

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