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エコヴィレッジはレンタカーがあればリッチの悪さはそんなに気にならないかもしれませんよ。西表島温泉はすぐ近くだし、上原方面も大原方面も車で20分程度かと思いますからね。まぁ上原ステイの方が便利といえば便利ですが、のんびりするならエコヴィレッジで海を眺めているのも良いかと思いますよ。

あとは行かれる時期は年始ということなのでツアーやお店が休みになるかいなか確認が必要ですね。地元の方は旧正月を祝うので大丈夫かもしれませんが、本土から来ている方は帰省している場合もありますので事前に確認すると良いかと思います。西表島ではやっぱりツアーに参加してジャングルを楽しむのがおすすめですからね。カヌーツアーなら冬場でも問題なく参加できますからね（冬の海は大荒れですがカヌーなら川なのでOKかも？）。

ちなみに西表島での宿泊は利便性を考慮するなら、他にもいろいろ宿はあると思いますよ。おそらくある程度の綺麗さをお求めのようかと思いますので、ティンヌカーラ、ヴィラうなりざき、ヴィラ芭蕉などもおすすめかと思います。ホテルならニラカナイになっちゃいますけどね。あとは利便性をとるか、ひたすら宿でのんびりをとるか次第かと思います。ちなみにツアーにいろいろ参加する場合は送迎対応してくれる上原周辺が良いかと思いますよ。エコヴィレッジは送迎対象外になる場合も多いですので。