沖縄離島ドットコム

既にいろいろ質問と回答が出ていますので、どう絡んで良いやら・・・（汗）

まずホテルの駐車は連休でも無い限りそんなに気にすることはないと思いますけどね。もし停めることができなくてもホテルの人に相談すれば近くの駐車場を紹介してくれると思いますので、ご心配いらないかと思いますよ。
けど初日は午後１時着だと、レンタカーの手配とかでいろいろ時間がかかりますので、ご予定通り那覇周辺を中心に考えると良いかもしれませんね。南部観光も有りかな？って思いましたが、それは最終日でも時間的に余裕があると思いますので、無理せずのんびりできるスケジュールが良いかな？って思います。
ですので初日はレンタカーをあまり使わずに、ゆいレールなどを活用しつつ那覇周辺を観光すると良いでしょう。

２日目は早めにホテルに到着したいのなら、那覇から一気に美ら海水族館まで行きましょう。その後に八重岳に行って桜を見ると良いかと思います。美ら海水族館の方が過ごす時間が長いと思いますので、先に行かれると良いかな？八重岳で桜を見たら、昼食を大家で食べると良いでしょう。時間があればそのまま近くのパイナップルパークへ行っても良いと思いますよ（フルーツランドはつまらないのでＮＧ）。
http://www.ritou.com/spot/view-hokubu-nh6.html

そこからならオクマまでは距離にして30km。１時間内には着くと思います。時間的に余裕があればその途中にある古宇利島へ寄って見るのも良いかもしれません。

そして最終日。確かに途中の読谷村や恩納村も良いですが（御菓子御殿のカフェは良いですね）、時間があまりにかかっちゃうので、一気に南下しちゃいましょう。
南部ドライブをするのなら、無理にオルカに乗らなくても新原ビーチや奥武島のグラスボートに乗っても良いかと思いますよ。どちらも乗ったことはないですが、南部観光のついでに乗れると思いますので、おすすめかと思いますよ。しかも奥武島なら管理人のお気に入りの天ぷら屋さんにも行けますしね。
オルカ　http://www.westmarine.co.jp/orca/index.html
新原ビーチ　http://www.mi-baru.com/
奥武島　http://www2.tontonme.ne.jp/users/oujima/

オクマからだと高速で南風原北ICで降りて、ニライカナイ橋へ向かうといいかも。ニライカナイ橋をドライブしてそのまま新原ビーチまで行けますからね。その後、おきなわワールド〜奥武島〜平和祈念公園〜ひめゆりの塔〜空港って感じになるかと思います。

最後にお土産ですが、国際通りで買わなくても空港で十分ですよね。むしろあの１カ所にあれだけお店があるのも圧巻です（笑）。あと最近この掲示板でもおすすめしている、沖縄の大型スーパーで買うのも有りですよ。南部観光から空港まで戻る間に、豊見城のマックスバリュ、那覇のジャスコなどもがありますからね。この２つは大型スーパーなので駐車場も広いですし、買い物も楽しいかと思います。