バーゲンフェアなどの2ヶ月前から売り出されるチケットを購入できれば良いのですが、2泊3日ならパッケージツアーでも良いかと思います。
1泊3日のツアーで行って、2泊のうち1泊はツアーに付いている
石垣島のホテルで。もう1泊は西表島のお好きな宿にすると安上がりかと思います。
http://www.ritoutours.com/ritoutour/西表島には2日目の朝の船で渡って、あとは西表島での過ごし方次第。帰りの飛行機が遅めなら丸2日近く西表島で過ごせますので、1日はレンタカーでいろいろ回って、もう1日はエコツアーが良いかな?って思います。
ちなみに初日は
石垣島泊になると思いますので(ツアーなので)、レンタカーを借りて
石垣島観光するか、竹富島あたりに日帰りするのが良いかと思います。
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