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海がメインなら与論島の方がおすすめだと思います。奄美は海もいいですが、山がメインになると思いますし、珊瑚や魚も与論島の方が豊富だと思います。宿に関しても与論島ではプリシアリゾートやコーラルホテルなら海が目の前ですし、もちろん泳ぐこともシュノーケリングもできると思います。

あと奄美の場合は島が広いのでレンタカーが無いと移動が難しいですし、ネイティブシーまでも空港や名瀬市街から距離があると思います。その点、与論島なら島がそんなに大きくないのでレンタカーが無くても事足りる場合もありますからね。

海も山もアクティブに過ごすなら奄美大島、海でのんびりするなら与論島がおすすめかと思いますよ。

ちなみにプリシアにする場合は、宿泊数次第ですがAコテージの2階はお勧めです。まさにオーシャンビューだし施設もキレイですからね。＋5000円の価値は十二分にあると思います（現地でグレードアップ可能）。

海のきれいさなら与論島のプリシアやコーラル、パークはキレイですよ。久米島のイーフビーチは砂浜はキレイですが海自体は遠浅なので海水浴しかできないって感じですからね。

コーラルパームス、ネイティブシー、ばしゃ村の３つはどこも同じレベルで個々に海はキレイですが、あとは奄美大島へのアクセス方法ですね。飛行機の便数に限りがありますし、奄美大島自体も大きいので移動に結構時間がかかると思いますよ。

与論島も時間のロスが大きいので、交通の面だと久米島が一番楽だし時間もかからないと思います（全て飛行機移動できるので）。

でも海のきれいさなら与論島がおすすめなんですけどね〜。ホテルはその候補の３つとも海はキレイですよ〜。ホテル自体は少々古めですが、そんなに気になる程度ではないと思います。
プリシアはコテージタイプですがオーシャンビューのコテージはとても少なめ。コーラルとパークはともにオーシャンビューですが、コーラルの方がタラソ施設もあるのでいろいろ楽しめるかな？

個人的には本命「与論島のプリシア」で、対抗が「与論島のコーラル」、穴が「久米島のイーフビーチホテル」って感じかな？あと大穴で「渡嘉敷島のマリンビレッジ」なんて感じもあると思いますよ。おそらく渡嘉敷島が最も交通費は安く済むと思いますし他の条件もほとんどクリアしていると思います（ただしリゾートホテルって感じではないです）^^;
http://www.kerama.in/view-tokashiki-tokashiku.html

管理人さん、早速ありがとうございます。
宿も飛行機もこれから予約なので、ツアーでとるつもりです。
奄美大島は羽田から直行便という便利さで一番に考えましたが、JALのツアーで一番安いのは与論島なんです〜。
管理人さんから「海のきれいさなら与論島」とのお墨付きも頂きましたので、与論島にします！子どもと一緒に魚を見るのが楽しみです。

ツアーなのでプリシアのオーシャンビューコテージ２階とコーラルがほぼ同価格。夫はコテージが希望ですが、子どもがいるので階下に騒音迷惑かも…。コーラルの和洋室のほうが子連れには便利そうですね〜コーラルに傾いています。

渡嘉敷島のマリンビレッジ、そうです、私のイメージしているのはこんな感じです〜。海がとってもきれいですね！でも、夫の第一希望の宮古島東急リゾートとは…違ってしまう〜残念、次の機会にはぜひ行ってみたいです。

管理人さんは、日曜はヨロンマラソンですね！無事に走って美味しいお酒を飲んでください〜。