沖縄離島ドットコム

民宿でもピンキリなのできちんと選べば大丈夫だと思います。波照間島ならみのる荘なんかがキレイでいいかもしれませんね。でもシャワーはどこの宿でもきちんと温水でますけどね（ただしボイラーを入れてもらわないと出ない場合あり・・・）。
竹富島では「さぷな家」なんかはキレイで良いかもしれませんね。ほかにもリゾート的な「ヴィラたけとみ」ってめっちゃキレイな宿もありますよ。
http://www.jalan.net/jalan/jweb/yado/YADS_325700.HTML
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最後に時期的な話ですが、比較対象にならないくらい６月末がおすすめです。５月末だと梅雨の真っ最中。６月末だと梅雨明け。ホントに６月末〜７月上旬の八重山は最高の季節ですよ。

長袖１枚でちょうどいい感じです。この時期の沖縄は、半袖Ｔシャツの
上に長袖を１枚着るって感じがいいと思います。まぁその日の天気や風
にも夜と思いますけど。１１月ならまだそんなに寒くないと思います
よ。最高気温２３度前後かと思います。内地での秋の装いで大丈夫です
よ。

マングローブはツアーを使わないなら浦内川になりますね。仲間川は基
本的にツアーですからね。浦内川はツアーもどきみたいなもので、滝の
入口まで行く渡し船に乗っている間に、マングローブの森を眺めること
が出来ますけどね。
でも大見謝ロードパークなんかならタダで間近にマングローブを見るこ
とが出来ますよ。結構おすすめだと思います。
http://www.ritou.com/spot/view-iriomote-ir43.html

あと由布は島に渡るとお金を取られるので、水牛に乗りたいならオスス
メですが、別に水牛に興味なければ島に渡らず、その風景を見るだけで
もいいかと思います。

あと竹富島の宿はここですね。
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めっちゃ高いですね（汗）。まぁそれなりのものはあるのでしょうが、
離島の宿としてはかなり高すぎるかな〜？って思いますけど。他の集落
から離れていて静かな場所ですね。

でも竹富島の宿の情報、どんな感じだったかレポートお待ちしておりま
〜す！ヨロシクです。