沖縄離島ドットコム

たしかにその時期は梅雨ですけど、内地みたいに毎日毎日雨って感じじゃないので、梅雨の合間の晴れ間を期待しましょう。
石垣島と宮古島の比較はちょっと違うかな？宮古はビーチ、石垣はシュノーケリングってイメージが管理人にはあります。
あと石垣がのどかな雰囲気、宮古がリゾート的な綺麗な雰囲気って感じもあります。
石垣島の観光ってのは、竹富島と石垣島の一部だけでそんなに観光色は強くないです。

ですので、リフレッシュの仕方にも寄りますが、シュノーケリングをアクティブにしたいのなら石垣島界隈の方がおすすめだと思いますよ。いろんな離島がありますので、その日の気分でいろんな海に行けますしね。

ちなみに宮古はレンタカーでの移動、八重山では船での移動が基本って考えて、車の運転の有無も選ぶポイントかもしれません。