沖縄離島ドットコム

沖縄のことが恋しくなると、こちらのサイトを見て楽しんでいます。
今回、幼児と赤ちゃんと家族四人で八重山に旅行します。アドバイスお願いします。
決まっているのは
１日目　最終便で那覇泊。(首里）
２日目　西表、上原泊。
　　　　間に合えば３時半からのホテルのシュノーケルツアーに１人で参加。
３日目　西表、上原泊。
　　　　５時半よりバラスサンセットシュノーケルに家族で参加。
４日目　石垣泊。
５日目　17時台の飛行気で、石垣発。

きれいな海で写真を撮ったり、シュノーケルをしたいのですが、こちらのサイトを見ていると、西表は海よりジャングルがメインという気がしてきました。
八重山で綺麗な海、ビーチはどこですか？
見た目が綺麗な海とシュノーケルに適した海が違うことは承知しています。どちらも行きたいと思います。
行ったことはないですが、波照間が適してると思いますが、幼児と赤ちゃん連れなので、船が厳しいと思い断念しました。
鳩間島かな？とか考えてますが、幼児と乳児を連れてレンタサイクルで回るのは厳しいでしょうか？

竹富のコインドビーチに行ったことがあるのですが、遠浅すぎてブルーが見えなくて、イマイチだったのですが、午前中で満潮付近に行けば、違った顔が見れるでしょうか？

那覇から石垣の飛行機が１２時２５分発で、今なら７時４０分発に変更できます。
ニライカナイ橋までドライブしてから（綺麗な海の写真がとれる？）１２時２５分の飛行機で石垣入りするか。それとも変更すれば午前中早い時間に離島に渡れるので、鳩間によってから西表入りするか、大原から入りレンタカーで観光してホテルに行くか迷ってます。
したいことは
先ほど質問している、綺麗な海で写真を撮る。
いだ浜に行く。
星の砂浜でシュノーケル。（本当は中野かまるビーチに行ってみたいが、子供がいるのでレストランで涼むことができるため）
マングローブのクルージング。（仲間川と浦内川どちらがお勧めですか？）
由布島の観光。（水牛に乗らす、景観を楽しむだけでもよい）
竹富観光。
です。　
子連れだというのに詰め込み過ぎかな？
本当は黒島でもシュノーケルしたいと考えましたが、スケジュール的に無理かなと思いあきらめました。
何度もスケジュールを考えるのですが、まとまりません。
アドバイスいただけたらと思います。よろしくお願いします。